Όταν η φλεγμονή είναι πολύ μεγάλη και το δόντι δε μπορεί να «σωθεί» μόνο με απονεύρωση κρίνεται απαραίτητη στις περισσότερες περιπτώσεις η διαδικασία της ακρορριζεκτομής. Πρόκειται για μια μικροχειρουργική διαδικασία, στην οποία ο εξειδικευμένος οδοντίατρος (συνήθως περιοδοντολόγος ή γναθοχειρουργός), προχωράει στην αποκάλυψη  των ούλων και απομακρύνει ένα μικρό κομμάτι ρίζας μαζί με το μολυσμένο ιστό. Η δε άκρη της ρίζας σφραγίζεται ερμητικά με ειδικό υλικό έμφραξης. Μετά το πέρας της διαδικασίας τοποθετούνται ράμματα στα ούλα για την επούλωση της πληγής.